Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLN6Q9NWW5 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms