Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP4

SDHAF3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF3Q9NRP4 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms