Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LHX9Q9NQ69 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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