Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NRIP3Q9NQ35 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms