Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARFGAP3Q9NP61 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARFGAP3Q9NP61 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARFGAP3Q9NP61 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARFGAP3Q9NP61 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARFGAP3Q9NP61 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARFGAP3Q9NP61 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms