Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CENPJQ9HC77 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms