Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms