Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR4

KRTAP4-3, Keratin-associated protein 4-3, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-3Q9BYR4 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms