Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms