Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRRTQ9BXP5 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SRRTQ9BXP5 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms