Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB11FIP5Q9BXF6 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB11FIP5Q9BXF6 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB11FIP5Q9BXF6 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB11FIP5Q9BXF6 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB11FIP5Q9BXF6 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB11FIP5Q9BXF6 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB11FIP5Q9BXF6 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB11FIP5Q9BXF6 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB11FIP5Q9BXF6 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB11FIP5Q9BXF6 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB11FIP5Q9BXF6 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB11FIP5Q9BXF6 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB11FIP5Q9BXF6 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB11FIP5Q9BXF6 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB11FIP5Q9BXF6 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB11FIP5Q9BXF6 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB11FIP5Q9BXF6 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB11FIP5Q9BXF6 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB11FIP5Q9BXF6 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB11FIP5Q9BXF6 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB11FIP5Q9BXF6 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB11FIP5Q9BXF6 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB11FIP5Q9BXF6 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB11FIP5Q9BXF6 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB11FIP5Q9BXF6 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB11FIP5Q9BXF6 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB11FIP5Q9BXF6 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB11FIP5Q9BXF6 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB11FIP5Q9BXF6 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB11FIP5Q9BXF6 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB11FIP5Q9BXF6 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB11FIP5Q9BXF6 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB11FIP5Q9BXF6 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB11FIP5Q9BXF6 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB11FIP5Q9BXF6 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB11FIP5Q9BXF6 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB11FIP5Q9BXF6 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB11FIP5Q9BXF6 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB11FIP5Q9BXF6 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB11FIP5Q9BXF6 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB11FIP5Q9BXF6 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB11FIP5Q9BXF6 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB11FIP5Q9BXF6 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB11FIP5Q9BXF6 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB11FIP5Q9BXF6 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms