Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms