Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms