Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPS6KC1Q96S38 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms