Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HDAC11Q96DB2 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HDAC11Q96DB2 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HDAC11Q96DB2 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HDAC11Q96DB2 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HDAC11Q96DB2 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HDAC11Q96DB2 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HDAC11Q96DB2 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HDAC11Q96DB2 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HDAC11Q96DB2 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HDAC11Q96DB2 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HDAC11Q96DB2 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HDAC11Q96DB2 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HDAC11Q96DB2 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HDAC11Q96DB2 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HDAC11Q96DB2 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HDAC11Q96DB2 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HDAC11Q96DB2 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HDAC11Q96DB2 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HDAC11Q96DB2 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HDAC11Q96DB2 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HDAC11Q96DB2 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HDAC11Q96DB2 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HDAC11Q96DB2 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms