Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms