Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms