Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TOPBP1Q92547 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms