Protein–RNA interactions for Protein: Q92485

SMPDL3B, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3BQ92485 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMPDL3BQ92485 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms