Protein–RNA interactions for Protein: Q8WU58

FAM222B, Protein FAM222B, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM222BQ8WU58 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM222BQ8WU58 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM222BQ8WU58 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM222BQ8WU58 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM222BQ8WU58 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM222BQ8WU58 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms