Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
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