Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PIK3C3Q8NEB9 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms