Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms