Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PBRM1Q86U86 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
PBRM1Q86U86 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
PBRM1Q86U86 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PBRM1Q86U86 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PBRM1Q86U86 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PBRM1Q86U86 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PBRM1Q86U86 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PBRM1Q86U86 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PBRM1Q86U86 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PBRM1Q86U86 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PBRM1Q86U86 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PBRM1Q86U86 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PBRM1Q86U86 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PBRM1Q86U86 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PBRM1Q86U86 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PBRM1Q86U86 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PBRM1Q86U86 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PBRM1Q86U86 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PBRM1Q86U86 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PBRM1Q86U86 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PBRM1Q86U86 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PBRM1Q86U86 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PBRM1Q86U86 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PBRM1Q86U86 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PBRM1Q86U86 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PBRM1Q86U86 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PBRM1Q86U86 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PBRM1Q86U86 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PBRM1Q86U86 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PBRM1Q86U86 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PBRM1Q86U86 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PBRM1Q86U86 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PBRM1Q86U86 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PBRM1Q86U86 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PBRM1Q86U86 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PBRM1Q86U86 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PBRM1Q86U86 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PBRM1Q86U86 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PBRM1Q86U86 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PBRM1Q86U86 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PBRM1Q86U86 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PBRM1Q86U86 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PBRM1Q86U86 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PBRM1Q86U86 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PBRM1Q86U86 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PBRM1Q86U86 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PBRM1Q86U86 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms