Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms