Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTF1AQ7RTS3 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
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