Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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