Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
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