Protein–RNA interactions for Protein: Q702N8

XIRP1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP1Q702N8 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
XIRP1Q702N8 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms