Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPS3

TPTE2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase TPTE2, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTE2Q6XPS3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPTE2Q6XPS3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms