Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms