Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms