Protein–RNA interactions for Protein: Q6PI47

KCTD18, BTB/POZ domain-containing protein KCTD18, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD18Q6PI47 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCTD18Q6PI47 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCTD18Q6PI47 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCTD18Q6PI47 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCTD18Q6PI47 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCTD18Q6PI47 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KCTD18Q6PI47 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCTD18Q6PI47 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCTD18Q6PI47 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCTD18Q6PI47 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCTD18Q6PI47 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCTD18Q6PI47 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCTD18Q6PI47 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCTD18Q6PI47 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCTD18Q6PI47 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCTD18Q6PI47 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCTD18Q6PI47 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCTD18Q6PI47 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCTD18Q6PI47 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCTD18Q6PI47 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCTD18Q6PI47 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCTD18Q6PI47 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCTD18Q6PI47 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCTD18Q6PI47 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCTD18Q6PI47 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCTD18Q6PI47 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCTD18Q6PI47 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD18Q6PI47 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD18Q6PI47 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD18Q6PI47 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD18Q6PI47 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD18Q6PI47 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD18Q6PI47 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD18Q6PI47 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD18Q6PI47 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD18Q6PI47 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD18Q6PI47 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD18Q6PI47 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD18Q6PI47 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD18Q6PI47 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD18Q6PI47 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD18Q6PI47 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD18Q6PI47 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD18Q6PI47 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD18Q6PI47 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD18Q6PI47 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD18Q6PI47 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD18Q6PI47 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD18Q6PI47 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD18Q6PI47 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD18Q6PI47 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD18Q6PI47 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD18Q6PI47 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD18Q6PI47 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD18Q6PI47 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD18Q6PI47 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD18Q6PI47 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD18Q6PI47 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD18Q6PI47 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD18Q6PI47 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD18Q6PI47 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD18Q6PI47 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD18Q6PI47 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD18Q6PI47 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD18Q6PI47 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD18Q6PI47 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD18Q6PI47 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD18Q6PI47 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCTD18Q6PI47 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCTD18Q6PI47 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCTD18Q6PI47 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCTD18Q6PI47 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCTD18Q6PI47 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCTD18Q6PI47 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCTD18Q6PI47 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCTD18Q6PI47 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCTD18Q6PI47 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCTD18Q6PI47 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCTD18Q6PI47 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCTD18Q6PI47 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KCTD18Q6PI47 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCTD18Q6PI47 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCTD18Q6PI47 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCTD18Q6PI47 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCTD18Q6PI47 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCTD18Q6PI47 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCTD18Q6PI47 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCTD18Q6PI47 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCTD18Q6PI47 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCTD18Q6PI47 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCTD18Q6PI47 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KCTD18Q6PI47 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCTD18Q6PI47 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCTD18Q6PI47 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCTD18Q6PI47 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCTD18Q6PI47 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCTD18Q6PI47 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KCTD18Q6PI47 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCTD18Q6PI47 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCTD18Q6PI47 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms