Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms