Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms