Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms