Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTXN3Q4LDR2 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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