Protein–RNA interactions for Protein: Q3LFD5

USP41, Putative ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 41, humanhuman

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Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41Q3LFD5 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP41Q3LFD5 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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