Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

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Length 1,700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
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