Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLPPQ16740 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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