Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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