Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms