Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
USF2Q15853 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
USF2Q15853 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
USF2Q15853 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
USF2Q15853 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
USF2Q15853 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
USF2Q15853 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
USF2Q15853 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
USF2Q15853 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
USF2Q15853 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
USF2Q15853 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
USF2Q15853 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
USF2Q15853 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
USF2Q15853 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
USF2Q15853 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
USF2Q15853 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
USF2Q15853 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
USF2Q15853 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
USF2Q15853 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
USF2Q15853 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
USF2Q15853 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
USF2Q15853 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
USF2Q15853 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
USF2Q15853 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
USF2Q15853 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
USF2Q15853 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
USF2Q15853 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
USF2Q15853 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
USF2Q15853 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
USF2Q15853 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
USF2Q15853 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
USF2Q15853 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
USF2Q15853 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
USF2Q15853 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
USF2Q15853 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
USF2Q15853 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
USF2Q15853 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
USF2Q15853 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
USF2Q15853 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
USF2Q15853 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
USF2Q15853 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
USF2Q15853 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
USF2Q15853 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
USF2Q15853 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
USF2Q15853 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
USF2Q15853 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
USF2Q15853 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
USF2Q15853 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
USF2Q15853 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
USF2Q15853 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
USF2Q15853 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
USF2Q15853 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
USF2Q15853 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
USF2Q15853 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
USF2Q15853 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
USF2Q15853 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
USF2Q15853 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
USF2Q15853 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
USF2Q15853 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
USF2Q15853 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
USF2Q15853 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
USF2Q15853 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
USF2Q15853 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
USF2Q15853 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
USF2Q15853 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
USF2Q15853 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
USF2Q15853 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
USF2Q15853 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
USF2Q15853 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
USF2Q15853 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
USF2Q15853 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
USF2Q15853 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
USF2Q15853 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
USF2Q15853 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
USF2Q15853 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
USF2Q15853 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
USF2Q15853 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
USF2Q15853 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
USF2Q15853 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
USF2Q15853 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
USF2Q15853 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
USF2Q15853 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
USF2Q15853 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
USF2Q15853 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
USF2Q15853 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
USF2Q15853 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
USF2Q15853 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
USF2Q15853 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
USF2Q15853 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
USF2Q15853 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
USF2Q15853 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
USF2Q15853 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
USF2Q15853 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
USF2Q15853 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
USF2Q15853 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
USF2Q15853 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
USF2Q15853 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
USF2Q15853 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
USF2Q15853 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
USF2Q15853 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms