Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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UBE3CQ15386 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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UBE3CQ15386 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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UBE3CQ15386 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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UBE3CQ15386 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE3CQ15386 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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