Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD3Q15054 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms