Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ARHGEF6Q15052 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ARHGEF6Q15052 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ARHGEF6Q15052 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ARHGEF6Q15052 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ARHGEF6Q15052 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ARHGEF6Q15052 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ARHGEF6Q15052 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ARHGEF6Q15052 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ARHGEF6Q15052 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
ARHGEF6Q15052 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ARHGEF6Q15052 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ARHGEF6Q15052 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ARHGEF6Q15052 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ARHGEF6Q15052 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ARHGEF6Q15052 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ARHGEF6Q15052 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ARHGEF6Q15052 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ARHGEF6Q15052 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ARHGEF6Q15052 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ARHGEF6Q15052 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ARHGEF6Q15052 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ARHGEF6Q15052 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ARHGEF6Q15052 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ARHGEF6Q15052 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ARHGEF6Q15052 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
ARHGEF6Q15052 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ARHGEF6Q15052 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ARHGEF6Q15052 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
ARHGEF6Q15052 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ARHGEF6Q15052 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ARHGEF6Q15052 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ARHGEF6Q15052 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ARHGEF6Q15052 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ARHGEF6Q15052 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ARHGEF6Q15052 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ARHGEF6Q15052 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ARHGEF6Q15052 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ARHGEF6Q15052 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ARHGEF6Q15052 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ARHGEF6Q15052 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ARHGEF6Q15052 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ARHGEF6Q15052 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ARHGEF6Q15052 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ARHGEF6Q15052 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ARHGEF6Q15052 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ARHGEF6Q15052 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ARHGEF6Q15052 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ARHGEF6Q15052 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ARHGEF6Q15052 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ARHGEF6Q15052 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ARHGEF6Q15052 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ARHGEF6Q15052 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ARHGEF6Q15052 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ARHGEF6Q15052 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ARHGEF6Q15052 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ARHGEF6Q15052 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
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ARHGEF6Q15052 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ARHGEF6Q15052 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ARHGEF6Q15052 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ARHGEF6Q15052 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ARHGEF6Q15052 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ARHGEF6Q15052 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
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ARHGEF6Q15052 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ARHGEF6Q15052 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ARHGEF6Q15052 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ARHGEF6Q15052 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ARHGEF6Q15052 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ARHGEF6Q15052 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ARHGEF6Q15052 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ARHGEF6Q15052 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ARHGEF6Q15052 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ARHGEF6Q15052 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ARHGEF6Q15052 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ARHGEF6Q15052 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ARHGEF6Q15052 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ARHGEF6Q15052 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ARHGEF6Q15052 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ARHGEF6Q15052 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ARHGEF6Q15052 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ARHGEF6Q15052 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ARHGEF6Q15052 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ARHGEF6Q15052 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ARHGEF6Q15052 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ARHGEF6Q15052 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ARHGEF6Q15052 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ARHGEF6Q15052 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ARHGEF6Q15052 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ARHGEF6Q15052 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ARHGEF6Q15052 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ARHGEF6Q15052 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ARHGEF6Q15052 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ARHGEF6Q15052 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ARHGEF6Q15052 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ARHGEF6Q15052 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ARHGEF6Q15052 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ARHGEF6Q15052 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms