Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms