Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CDK13Q14004 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
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