Protein–RNA interactions for Protein: Q13630

TSTA3, GDP-L-fucose synthase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3Q13630 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSTA3Q13630 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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