Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PKD2Q13563 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
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